Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930519G04RikQ9CPT7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930519G04RikQ9CPT7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930519G04RikQ9CPT7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms