Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bap1Q99PU7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bap1Q99PU7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bap1Q99PU7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms