Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim26Q99PN3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim26Q99PN3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms