Protein–RNA interactions for Protein: Q99N17

Cyp4f16, Cytochrome P450 CYP4F16, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f16Q99N17 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f16Q99N17 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp4f16Q99N17 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f16Q99N17 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f16Q99N17 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f16Q99N17 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f16Q99N17 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp4f16Q99N17 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms