Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Atp1b4Q99ME6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Atp1b4Q99ME6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1b4Q99ME6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms