Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdpd3Q99LY2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdpd3Q99LY2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms