Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms