Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf19Q99KP6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf19Q99KP6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf19Q99KP6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms