Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn16Q925N4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms