Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1l1Q923U0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l1Q923U0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1l1Q923U0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms