Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf3Q920N1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms