Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6cQ91ZQ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6cQ91ZQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms