Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf6Q91YR7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms