Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps36Q91XD6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps36Q91XD6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps36Q91XD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms