Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klc3Q91W40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Klc3Q91W40 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klc3Q91W40 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms