Protein–RNA interactions for Protein: Q91V81

Rbm42, RNA-binding protein 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm42Q91V81 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm42Q91V81 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm42Q91V81 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbm42Q91V81 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbm42Q91V81 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbm42Q91V81 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm42Q91V81 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm42Q91V81 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm42Q91V81 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm42Q91V81 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm42Q91V81 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms