Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEH2

Ciz1, CDKN1A-interacting zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciz1Q8VEH2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ciz1Q8VEH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ciz1Q8VEH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ciz1Q8VEH2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ciz1Q8VEH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ciz1Q8VEH2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms