Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc28Q8VCE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc28Q8VCE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms