Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4cQ8VCD7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm4cQ8VCD7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms