Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FntbQ8K2I1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FntbQ8K2I1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FntbQ8K2I1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FntbQ8K2I1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FntbQ8K2I1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FntbQ8K2I1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FntbQ8K2I1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FntbQ8K2I1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FntbQ8K2I1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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