Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brd3Q8K2F0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brd3Q8K2F0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd3Q8K2F0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms