Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Hpf1Q8CFE2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Hpf1Q8CFE2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hpf1Q8CFE2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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