Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup88Q8CEC0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup88Q8CEC0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms