Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc87Q8CDL9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms