Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vcpip1Q8CDG3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vcpip1Q8CDG3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms