Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC7

Ftsj1, Putative tRNA (cytidine(32)/guanosine(34)-2'-O)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj1Q8CBC7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj1Q8CBC7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj1Q8CBC7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj1Q8CBC7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj1Q8CBC7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj1Q8CBC7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj1Q8CBC7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj1Q8CBC7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ftsj1Q8CBC7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj1Q8CBC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms