Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slfn5Q8CBA2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms