Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8C1R3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8C1R3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8C1R3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8C1R3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8C1R3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8C1R3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8C1R3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8C1R3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8C1R3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8C1R3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8C1R3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8C1R3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8C1R3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8C1R3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C1R3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8C1R3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms