Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Csgalnact2Q8C1F4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csgalnact2Q8C1F4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms