Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh12Q8BYK4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh12Q8BYK4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms