Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx1bQ8BX32 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Slx1bQ8BX32 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx1bQ8BX32 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms