Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp38Q8BW70 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp38Q8BW70 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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