Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVQ5

Ppme1, Protein phosphatase methylesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppme1Q8BVQ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppme1Q8BVQ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppme1Q8BVQ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppme1Q8BVQ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms