Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx17Q8BVL3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx17Q8BVL3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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