Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10600Q8BQ57 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10600Q8BQ57 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm10600Q8BQ57 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms