Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga3Q8BMI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gga3Q8BMI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms