Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Me3Q8BMF3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms