Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af1l4Q8BGJ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms