Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a9Q8BGD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc38a9Q8BGD6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a9Q8BGD6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms