Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrtm2Q8BGA3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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