Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sv2bQ8BG39 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sv2bQ8BG39 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sv2bQ8BG39 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms