Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4cQ811C2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4cQ811C2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4cQ811C2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms