Protein–RNA interactions for Protein: Q80UZ0

Fgd5, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd5Q80UZ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fgd5Q80UZ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd5Q80UZ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd5Q80UZ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd5Q80UZ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms