Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf653Q6YND2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf653Q6YND2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf653Q6YND2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf653Q6YND2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms