Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b4Q6Q477 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2b4Q6Q477 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b4Q6Q477 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b4Q6Q477 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms