Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Herc4Q6PAV2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Herc4Q6PAV2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms