Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trak2Q6P9N8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak2Q6P9N8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms