Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgb4Q6P8W9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgb4Q6P8W9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms