Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam222bQ6P539 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms