Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Frg2f1Q6P3A2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frg2f1Q6P3A2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Frg2f1Q6P3A2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms